绘制澳大利亚虎虾基因组图
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詹姆斯·库克大学(James Cook University)的研究人员是首次成功绘制澳大利亚标志性海产品物种——澳大利亚黑虎虾——基因组图谱的一部分,这可能会导致未来养殖规模更大、抗病性更强的对虾。
JCU水产养殖学教授Dean Jerry说,这项研究来自于JCU、澳大利亚基因组研究机构(AGRF)、悉尼大学、CSIRO和海航集团的ARC产业转型研究中心。该伙伴关系旨在通过基因选择提高养殖对虾的生产力和效率。
他说:“这个想法是为了提高澳大利亚对虾养殖户的能力,使他们能够采用选择性养殖方法生产更大、更健康的养殖对虾。作为该项目的一部分,我们着手对黑虎虾的基因组进行测序。基因组中的信息对我们来说很重要,因为它基本上包含了决定对虾组成和行为的蓝图。”杰瑞教授。
他说,拥有这种基因组的一个好处是,它可以极大地帮助对虾的选择性繁殖工作,类似于过去几千年来牲畜和作物物种的情况。
“对虾是一种很小的动物,但它的基因组几乎和人类一样大,而且其结构要复杂得多,”杰里教授说。
AGRF生物信息学经理Kenneth Chan博士表示,重建黑虎虾基因组的基因图谱过程非常棘手。
陈博士说:“想象一下,把一个19亿块的双面拼图拼在一起,没有边界、长时间重复的重叠部分、数百万块缺失的拼图、可以放在同一个地方的多块拼图、盒子上没有可以跟随的图片,可能还有许多来自另一个不相关拼图的拼图。”。
科学家们还发现虎虾对抗病毒感染的方式非常不寻常。
CSIRO的高级研究科学家尼克·韦德博士解释说,基因组中有助于对抗病毒感染的病毒成分(称为内源性病毒成分或EVE)在澳大利亚虎虾中是真正独特的。
韦德博士说:“在其他任何动物身上都找不到这种夏娃。”。
他说:“这个EVE的发现有助于进一步研究对虾如何应对病毒感染,或许还有助于研究新的疗法,使对虾对病毒疾病具有更强的抵抗力。”。
杰里教授说,绘制基因组图谱的好处将来自一系列互补的领域。
杰里教授说:“这从根本上改变了对虾研究的格局,实现了一整套其他功能生物学研究,包括如何针对特定基因以改善选择结果,直至精确的基因组工程。”。
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